Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms