Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTGFP29279 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTGFP29279 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTGFP29279 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTGFP29279 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms