Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMLP26374 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMLP26374 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMLP26374 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms