Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms