Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms