Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCP20941 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCP20941 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCP20941 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCP20941 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCP20941 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCP20941 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCP20941 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms