Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms