Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms