Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms