Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB1P14653 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms