Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms