Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms