Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RALAP11233 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RALAP11233 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RALAP11233 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RALAP11233 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RALAP11233 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RALAP11233 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RALAP11233 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms