Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHGAP10645 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHGAP10645 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms