Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms