Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD1P0DJD0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms