Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms