Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSF1P09603 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSF1P09603 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF1P09603 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF1P09603 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF1P09603 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms