Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP10P09238 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP10P09238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP10P09238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms