Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms