Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGFRP00533 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms