Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYF2O95926 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYF2O95926 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms