Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNTO95613 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNTO95613 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNTO95613 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNTO95613 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNTO95613 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNTO95613 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms