Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF3O95398 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF3O95398 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms