Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPINO95295 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPINO95295 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPINO95295 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms