Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD4O95243 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms