Protein–RNA interactions for Protein: O75691

UTP20, Small subunit processome component 20 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20O75691 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP20O75691 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP20O75691 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP20O75691 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP20O75691 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP20O75691 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP20O75691 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP20O75691 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP20O75691 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms