Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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