Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms