Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ2O43526 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms