Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ3O43525 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms