Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTIFO43310 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTIFO43310 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTIFO43310 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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