Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIAH2O43255 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms