Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms