Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP290O15078 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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CEP290O15078 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP290O15078 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP290O15078 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP290O15078 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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