Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms