Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASKO14936 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASKO14936 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASKO14936 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms