Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3AO14802 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms