Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms