Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCRIP1C9JLW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCRIP1C9JLW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms