Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DSR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DSR2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DSR2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms