Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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