Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms