Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLTPD2A6NH11 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLTPD2A6NH11 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms