Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms