Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms