Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCZQ96LD1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCZQ96LD1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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