Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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