Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDAP1Q13442 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms