Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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